Bajdenova prva supruga Neilija i 13-mesečna ćerka Naomi poginule su nedugo nakon što je Bajden izabran za senatora 1972. godine. Sinovi Bo i Hanter, koji su u vreme nesreće imali 4 i 3 godine, bili su teško povređeni.
Bajden se 1977. godine oženio sa Džil Džejkobs, s kojom ima ćerku Ešli. Bo je preminuo od tumora na mozgu 2015. godine, a Hanter je kasnije bio u vezi sa njegovom udovicom.
Predsednik SAD-a Džo Bajden prvi put je javno priznao sedmo unuče tek ove godine.